Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPUSD2Q8IZ73 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPUSD2Q8IZ73 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPUSD2Q8IZ73 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms