Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR49Q8IV35 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR49Q8IV35 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms