Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYT12Q8IV01 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT12Q8IV01 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms