Protein–RNA interactions for Protein: Q86X95

CIR1, Corepressor interacting with RBPJ 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIR1Q86X95 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CIR1Q86X95 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIR1Q86X95 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIR1Q86X95 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIR1Q86X95 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIR1Q86X95 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIR1Q86X95 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIR1Q86X95 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIR1Q86X95 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CIR1Q86X95 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms