Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMC3Q7Z5M5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC3Q7Z5M5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms