Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KRT25Q7Z3Z0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT25Q7Z3Z0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT25Q7Z3Z0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms