Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SSX7Q7RTT5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SSX7Q7RTT5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms