Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
OTOP3Q7RTS5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTOP3Q7RTS5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTOP3Q7RTS5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms