Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTF1AQ7RTS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTF1AQ7RTS3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTF1AQ7RTS3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms