Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFLNAQ6ZTI6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFLNAQ6ZTI6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms