Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHISA6Q6ZSJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SHISA6Q6ZSJ9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms