Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRCAPQ6ZRS2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SRCAPQ6ZRS2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SRCAPQ6ZRS2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms