Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATRAIDQ6UW56 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATRAIDQ6UW56 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms