Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TXNDC11Q6PKC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TXNDC11Q6PKC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TXNDC11Q6PKC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms