Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK18

OGFOD3, 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OGFOD3Q6PK18 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OGFOD3Q6PK18 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OGFOD3Q6PK18 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms