Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AAGABQ6PD74 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AAGABQ6PD74 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms