Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EMBQ6PCB8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms