Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q6P435 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q6P435 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q6P435 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6P435 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6P435 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6P435 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6P435 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6P435 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q6P435 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6P435 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6P435 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6P435 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6P435 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6P435 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6P435 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6P435 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6P435 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6P435 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6P435 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6P435 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6P435 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6P435 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6P435 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6P435 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6P435 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6P435 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6P435 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6P435 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6P435 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6P435 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms