Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSANTD2Q6P1R3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSANTD2Q6P1R3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MSANTD2Q6P1R3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms