Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MRPL54Q6P161 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MRPL54Q6P161 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms