Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDD2Q6NTF9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHBDD2Q6NTF9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHBDD2Q6NTF9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms