Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGB2Q6NT52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CGB2Q6NT52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms