Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT80Q6KB66 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT80Q6KB66 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms