Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARA3Q6AZY7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCARA3Q6AZY7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms