Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TXNDC8Q6A555 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TXNDC8Q6A555 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms