Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATRNL1Q5VV63 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRNL1Q5VV63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRNL1Q5VV63 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRNL1Q5VV63 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRNL1Q5VV63 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRNL1Q5VV63 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRNL1Q5VV63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRNL1Q5VV63 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATRNL1Q5VV63 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms