Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPRD2Q5VT52 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RPRD2Q5VT52 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPRD2Q5VT52 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms