Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIF1Q5UIP0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIF1Q5UIP0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIF1Q5UIP0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms