Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CEP170Q5SW79 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CEP170Q5SW79 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CEP170Q5SW79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CEP170Q5SW79 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms