Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SAPCD1Q5SSQ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SAPCD1Q5SSQ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms