Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAX1Q5SQQ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAX1Q5SQQ9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms