Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC27A3Q5K4L6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC27A3Q5K4L6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC27A3Q5K4L6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
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