Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAB41Q5JT25 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB41Q5JT25 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms