Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX7

PLEKHG4, Puratrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG4Q58EX7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLEKHG4Q58EX7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLEKHG4Q58EX7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PLEKHG4Q58EX7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms