Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB6CQ53S08 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6CQ53S08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms