Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ACSM3Q53FZ2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ACSM3Q53FZ2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms