Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC01620Q4KN68 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01620Q4KN68 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms