Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CERKLQ49MI3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CERKLQ49MI3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CERKLQ49MI3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms