Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC14Q49A88 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC14Q49A88 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC14Q49A88 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC14Q49A88 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC14Q49A88 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms