Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C18orf21Q32NC0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C18orf21Q32NC0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf21Q32NC0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf21Q32NC0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf21Q32NC0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf21Q32NC0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf21Q32NC0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf21Q32NC0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf21Q32NC0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms