Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LETM2Q2VYF4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LETM2Q2VYF4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LETM2Q2VYF4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms