Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3G0

ABCB5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB5Q2M3G0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ABCB5Q2M3G0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCB5Q2M3G0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCB5Q2M3G0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms