Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ISXQ2M1V0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ISXQ2M1V0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms