Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TBR1Q16650 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TBR1Q16650 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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