Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 SEPT11-202ENST00000502401 276 ntTSL 54.64□□□□□ -1.672e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 44.33□□□□□ -1.722e-8■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 PGGHG-207ENST00000482937 734 ntTSL 513.68□□□□□ -0.224e-10■■■□□ 15.3
SRSF7Q16629 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-8■■■□□ 15.2
SRSF7Q16629 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 512.24□□□□□ -0.453e-8■■■□□ 15.2
SRSF7Q16629 PACSIN2-207ENST00000422336 664 ntTSL 59.46□□□□□ -0.93e-8■■■□□ 15.2
SRSF7Q16629 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 59.11□□□□□ -0.953e-8■■■□□ 15.2
SRSF7Q16629 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 39.43□□□□□ -0.97e-8■■■□□ 15.2
SRSF7Q16629 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.893e-8■■■□□ 15.2
SRSF7Q16629 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.443e-8■■■□□ 15.2
SRSF7Q16629 MORF4L2-212ENST00000474653 573 ntTSL 25.57□□□□□ -1.522e-11■■■□□ 15.1
SRSF7Q16629 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.762e-11■■■□□ 15.1
SRSF7Q16629 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.394e-6■■■□□ 15
SRSF7Q16629 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-6■■■□□ 15
SRSF7Q16629 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.574e-6■■■□□ 15
SRSF7Q16629 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.664e-6■■■□□ 15
SRSF7Q16629 ACIN1-206ENST00000473758 3540 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.914e-6■■■□□ 15
SRSF7Q16629 POLE3-204ENST00000479871 2396 ntTSL 212.4□□□□□ -0.433e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-209ENST00000437745 1711 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.513e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.773e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-214ENST00000630952 1721 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.863e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-204ENST00000415365 1405 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.863e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.923e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-212ENST00000452975 1464 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-202ENST00000405202 1689 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.13e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-207ENST00000433922 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.123e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.123e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-208ENST00000436868 1784 ntTSL 57.27□□□□□ -1.253e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.253e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 BZW2-206ENST00000432311 800 ntTSL 36.88□□□□□ -1.313e-8■■■□□ 15
SRSF7Q16629 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-31■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 SEPT9-219ENST00000588575 559 ntTSL 416.05■□□□□ 0.168e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.128e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.224e-7■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.34e-7■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 MSI2-207ENST00000579205 500 ntTSL 412.36□□□□□ -0.434e-7■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-207ENST00000572346 567 ntTSL 411.81□□□□□ -0.523e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.642e-7■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.723e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.793e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-213ENST00000573519 654 ntTSL 1 (best)9.86□□□□□ -0.833e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-206ENST00000571714 676 ntTSL 58.58□□□□□ -1.043e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-219ENST00000576713 571 ntTSL 57.52□□□□□ -1.213e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-210ENST00000572824 559 ntTSL 47.08□□□□□ -1.283e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NPLOC4-211ENST00000573212 564 ntTSL 46.21□□□□□ -1.423e-8■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 NAA15-207ENST00000496716 677 ntTSL 35.65□□□□□ -1.52e-6■■■□□ 14.9
SRSF7Q16629 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.779e-7■■■□□ 14.8
SRSF7Q16629 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-9■■■□□ 14.8
SRSF7Q16629 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.982e-9■■■□□ 14.8
SRSF7Q16629 SET-205ENST00000409104 962 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.222e-9■■■□□ 14.8
SRSF7Q16629 SET-202ENST00000372686 1029 ntTSL 24.15□□□□□ -1.752e-9■■■□□ 14.8
SRSF7Q16629 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.862e-9■■■□□ 14.8
SRSF7Q16629 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-7■■■□□ 14.7
SRSF7Q16629 NAP1L1-223ENST00000552013 679 ntTSL 25.37□□□□□ -1.559e-7■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 BCL7A-202ENST00000432926 871 ntTSL 217.54■□□□□ 0.45e-8■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.345e-8■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.075e-8■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 519.79■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 319.79■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-213ENST00000482806 1826 ntTSL 518.82■□□□□ 0.61e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-215ENST00000489884 1751 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-216ENST00000496663 818 ntTSL 217.26■□□□□ 0.351e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-205ENST00000461979 720 ntTSL 516.77■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.011e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FASTK-204ENST00000460980 1521 ntTSL 513.13□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.993e-9■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.263e-9■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 NAP1L1-211ENST00000547969 543 ntTSL 45.08□□□□□ -1.63e-8■■■□□ 14.6
SRSF7Q16629 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.149e-7■■□□□ 14.5
SRSF7Q16629 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.39e-7■■□□□ 14.5
SRSF7Q16629 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.729e-7■■□□□ 14.5
SRSF7Q16629 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.582e-8■■□□□ 14.4
SRSF7Q16629 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 212.62□□□□□ -0.391e-14■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 FHOD1-209ENST00000569085 735 ntTSL 211.14□□□□□ -0.631e-14■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-14■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.913e-11■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.923e-11■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.993e-11■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.821e-6■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 DEK-207ENST00000515742 661 ntTSL 218.71■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 DEK-204ENST00000505224 1372 ntTSL 211.77□□□□□ -0.532e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 DEK-203ENST00000503715 580 ntTSL 510.73□□□□□ -0.692e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.622e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-206ENST00000544816 1597 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-205ENST00000542344 1675 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.922e-7■■□□□ 14.3
SRSF7Q16629 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-7■■□□□ 14.3
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