Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDB1Q16531 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDB1Q16531 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
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