Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GRIK4Q16099 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIK4Q16099 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIK4Q16099 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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