Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL1Q16048 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL1Q16048 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMCHL1Q16048 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PMCHL1Q16048 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PMCHL1Q16048 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms