Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RAB11BQ15907 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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RAB11BQ15907 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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