Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HERC1Q15751 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
HERC1Q15751 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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